Folding@Home
Установка ПО Folding@Home в Alt linux.
Folding@Home — проект распределённых вычислений поведения белковых молекул для решения теоретических задач биохимии человека. В рамках Folding@Home изучаются биохимические механизмы нескольких болезней, в т.ч. COVID-19, болезни Альцгеймера и Паркинсона. Сайт проекта предлагает всем желающим выполнять этапы расчётов на своём компьютере или смартфоне. Существуют версии под GNU/Linux, но только для Debian/Ubuntu и RedHat/Centos/Fedora. Установка в Alt linux имеет свои особенности.
1. Загружаем RPM-пакеты.
Их три:
- fahclient — собственно программа ведения расчётов, может работать в режиме демона (основной режим), но может работать и из командной строки;
- fahcontrol — программа управления клиентом, она не обязательна (у клиента есть вебинтерфейс), но удобна;
- fahviewer — программа визуализации (практического смысла не имеет).
На странице Linux Install Guide указаны три команды загрузки. Из этих команд нам нужны только URI пакетов, точные ссылки для версии 7.4.4-1 для платформы x86-86:
- https://download.foldingathome.org/releases/public/release/fahclient/centos-6.7-64bit/v7.6/fahclient-7.6.21-1.x86_64.rpm
- https://download.foldingathome.org/releases/public/release/fahcontrol/centos-6.7-64bit/v7.6/fahcontrol-7.6.21-1.noarch.rpm
- https://download.foldingathome.org/releases/public/release/fahviewer/centos-6.7-64bit/v7.6/fahviewer-7.6.21-1.x86_64.rpm
Необходимы только две первые.
Для других версий достаточно найти свежие пакеты *.rpm для своей платформы в https://download.foldingathome.org/releases/public/release/fahclient/ и https://download.foldingathome.org/releases/public/release/fahcontrol/ (и в https://download.foldingathome.org/releases/public/release/fahviewer/, если нравятся картинки молекул).
2. Устанавливаем.
Сначала устанавливаем fahcontrol, потом fahclient. Дело в том, что postinstall пакета fahclient запускает демон (выполняет стартовый скрипт /etc/init.d/FAHClient start)
Пакет fahcontrol-7.4.4-1.noarch.rpm зависит от python2.6 и для его работы требуется питоновский модуль sqlite3.
Из-за неразрешимой зависимости необходимо устанавливать пакет с опцией --nodep:
sudo rpm -i --nodep fahcontrol-7.4.4-1.noarch.rpm
После установки fahcontrol требуется сделать симлинк из библиотеки для python 2.6 в библиотеку для python 2.7:
sudo ln -s /usr/lib/python2.6/site-packages/fah /usr/lib/python2.7/site-packages/fah
Также нужно установить питоновский модуль для sqlite3:
sudo apt-get install python-modules-sqlite3
Пакет fahclient-7.4.4-1.x86_64.rpm имеет зависимости от expat, на самом деле ненужную, и bzip-lib2, этот пакет в Altlinux называется bzip2-lib. Этот пакет также нужно устанавливать с --nodep:
sudo rpm -i --nodep fahclient-7.4.4-1.x86_64.rpm
3. Настраиваем.
Запустите fahcontrol либо из командной строки (/usr/bin/FAHControl), либо из меню "Приложения" (он в разделе "Образование"). Дальше кликните "Configure" и настраивайте. Инструкция на сайте.
В расчёте можно использовать ресурсы (GPU) видеокарты (и даже нужно, потому что это эффективнее), для этого нужно его включить в настройке на вкладке "Slots". Например, чтобы использовать и CPU, и GPU, добавьте слот и измените его, переключив на GPU.
Чтобы можно было меряться "попугаями" в окне Configure на вкладке "Identity" задайте (произвольный) ник. Чтобы получать более сложные задания (и заработать больше очков), зарегистрируйтесь на сайте проекта, ссылка есть в FAHControl в окне configure на вкладке "Identity", затем на той же вкладке введите полученный ключ-пароль (passkey).
Среди расчётчиков идёт своебразное соревнование, они объединяются в команды. Русских команд в проекте несколько. Самая активная в этом году — Transhumans, cамая активная за всю историю проекта Folding@Home — TSC! Russia